リポジトリの概要
iCROWNでは研究実施機関・準研究実施機関等から検体・臨床情報を収集し、調整した試料・臨床情報・試料から得られたゲノム解析情報を保管しています（リポジトリ）。これらの試料・データは病態解明、重症化因子・予後因子の解明、診断や治療方法の改善、並びに医薬品等の開発に資する研究などに利活用することができます。これらの試料・データがさまざまな医学研究や開発等に広く利活用されることで、感染症分野をはじめ、医学全般の進歩を促進することを目的としています。
対象感染症
現在のiCROWNの対象感染症は、以下の通りです。
- 重症急性呼吸器感染症（新型コロナウイルス感染症を含む）
- エムポックス
- 原因不明小児肝炎
- 重点感染症※1
- 入国時感染症ゲノムサーベイランスの試料※2
※1 第96回厚生科学審議会感染症部会（2025年6月12日）において、重点感染症が対象感染症に追加されることが承認された。iCROWN事務局において、収集体制等が整い次第、運用を開始する。
（参考）染症臨床研究ネットワーク（iCROWN）における対象感染症の追加について↗
※2 厚生労働省が実施する「入国時サーベイランス」事業の残余検体などの提供を受けています。
（参考）入国時感染症ゲノムサーベイランス↗
iCROWNのリポジトリで収集する試料・データ
新興・再興感染症の試料・データを感染症研究等にお役立てください
・臨床情報
（例）
| 基本情報 | ・年齢 ・性別 ・併存疾患 ・身長/体重 ・初診日/入院日/発症日 |
| 感染症に関する情報 | ・対象疾患の検査結果 ・その他病原体検査結果 ・対象疾患のワクチン接種歴 |
| 入院や治療に関する情報 | ・入院時症状 ・転帰 ・治療内容 ・入院経過（体温、SpO2、HRなど） |
・試料
| ・血漿 ・PBMC（抹消血単核球細胞） ・ヒトDNA ・唾液 ・ぬぐい液（鼻咽頭、鼻前庭、咽頭、皮膚病変） ・便 |
・ヒトゲノム解析データ
| ・Rawデータ FASTQ形式 要相談 ・マッピングデータ CRAM形式 要相談 ・ゲノム多型データ gVCF（Genomic Variant Call Format）, VCF（Variant Call Format） |